Нашел глюк в теме, при включении показа ячейки количества единиц товара в каталоге с товарами (Quantity input в Product lists/Carousels), цена минимального количества продажи товара берется не с комбинации какая стоит в данный момент, а с простого товара, что стоял перед этим. Тоесть если перед этим в простом товаре стояло 5, а при смене в комбинации поставить 50, то через каталог товаров нельзя будет купить просто клацнув на кнопку, будет выкидать ошибку из-за того что там стоит значение из простого товара 5. Если зайти в сам товар, то там все показывает правильно.
А в самом престашопе, покрайней мере в версии 1.7.6.3, количество товара суммируется с значением в веденном в простом товаре вместе с значением в комбинации. Если, например, в простом товаре стояло 500 едениц на складе и сменить на комбинацию и там еще поставить 500, то в списке товаров показывает что на складе 1000 едениц товара.