было такое както, решал подгрузкой таблиц назначения сами хуки ptks_hook, потом таблица с модулями ptks_module , и таблица соотношения id хуков с id модулей ptks_hook_module. Нужно проверить эти таблицы возможно во время установки он и не были перезаписаны. У Werihouse свои отличные от стандарных модули и хуки и при установке он выбрасывает списки модулей которые надо доустановить и которые надо удалить, возможно по какойто причине эта процедура у вас не выполнилась. Таблицы для подгрузки можно взять с чистой установки, ну и плюс коректировать ваши старые модули с новым шаблоном. Удобней всего это можно сделать через Навикат.