несколько сотен ключей об одном и том же

[_sergey_]

что-то не особо выходит разбить логически всё это...
Плюс по некоторым ключа стата еще по рамблеру, например, 8 запросов за месяц.
По яше в несколько раз больше ( запрос в яндексе брал в кавычках )
Без кавычек - несколько тысяч ( хотя если сложить входящие запросы в этот запрос, несколько тысяч никак не получаются )
Стоит ли такие запросы учитывать?

Стоит. Число запросов в Рамблере, только для отсева пустышек учитывайте, и выбора нужного порядка слов в фразе. Трафик будет в основном с Гугла, Мэйла и Яндекса.

В Яндексе надо смотреть так: "!ключ".