Быстрее и без геморроя хранить значения в БД.
Можно и в 1 массиве хранить — но тогда в виде подмножества массивов с ключ=значение
Это дело потом сериализовать и записывать в файл.
Функция serialize для этого служит.
Выборка — десериализовать:
PHP:
$array=unserialize(file_get_contents($file));