Если сервер слабенький, и единственное, что ограничивает от отказа от панели вовсе. То могу посоветовать
Для просмотра ссылки Войди или Зарегистрируйся По сути, это скрипт, с помощью которого можно проще и удобнее настроить стек без использования gui интерфейса. Заодно еще можно немного подучить как настраивать тот или иной сервис вручную.
А вообще, что касается настройки ручками, это не так сложно как кажется. Просто для всего нужно будет отдельно запускать разные команды, а так же изменять некоторые значения в стандартных конфигах. Если хочется како-то профессионального развития, то советую попробовать научиться. Так хотя бы будет понятно что и как работает, а так же научитесь работать с линуксом. Небольшая база по системному администрированию, на мой взгляд, никогда не навредит.
Кстати, на счет пользователей - разные пользователи необязательно нужны для создания хостинга. Неплохая практика - изолировать ресурсы друг от друга. Да даже, например, если хостится несколько проектов, а другому разрабу нужно выдать доступ, но только к этому проекту, чтобы ничего лишнего утащить не смог.